Mus musculus Gene: Gcdh | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-175137.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gcdh | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000003809 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase
glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase
glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000105607:
The protein encoded by this gene belongs to the acyl-CoA dehydrogenase family. It catalyzes the oxidative decarboxylation of glutaryl-CoA to crotonyl-CoA and CO(2) in the degradative pathway of L-lysine, L-hydroxylysine, and L-tryptophan metabolism. It uses electron transfer flavoprotein as its electron acceptor. The enzyme exists in the mitochondrial matrix as a homotetramer of 45-kD subunits. Mutations in this gene result in the metabolic disorder glutaric aciduria type 1, which is also known as glutaric acidemia type I. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 12. [provided by RefSeq, Mar 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:84886393-84893921 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Metabolism pathway
Metabolism of amino acids and derivatives pathway
Lysine catabolism pathway
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KEGG |
Lysine degradation pathway
Tryptophan metabolism pathway
Fatty acid degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Lysine catabolism pathway
Metabolism of amino acids and derivatives pathway
Metabolism pathway
Metabolism of amino acids and derivatives pathway
Lysine catabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Tryptophan metabolism pathway
Fatty acid degradation pathway
Lysine degradation pathway
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INOH |
Tryptophan degradation pathway
Lysine degradation pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.2475 Mm.441341 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001044744 NM_008097 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22482 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||