Mus musculus Gene: Abcb11 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-176110.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Abcb11 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 11 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ABC16; Bsep; Lith1; PFIC2; PGY4; SPGP | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027048 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 11
ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 11
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The membrane-associated protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the MDR/TAP subfamily. Members of the MDR/TAP subfamily are involved in multidrug resistance. The protein encoded by this gene is the major canalicular bile salt transporter in humans and mice. Mutations in the human gene cause a form of progressive familial intrahepatic cholestases which are a group of inherited disorders with severe cholestatic liver disease from early infancy. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:69238282-69342616 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Recycling of bile acids and salts pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Synthesis of bile acids and bile salts pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol pathway
Bile acid and bile salt metabolism pathway
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KEGG |
ABC transporters pathway
Bile secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol pathway
Synthesis of bile acids and bile salts pathway
Recycling of bile acids and salts pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Bile acid and bile salt metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
ABC transporters pathway
Bile secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | J3QNY6 Q9JL39 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 27413 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.439855 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_006499669 NM_021022 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16090 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1351619 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Abcb11 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF213392 AL929170 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF31431 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 27413 | ||||||||||||||||||||||