Mus musculus Gene: Ogg1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-176301.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ogg1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | 8-oxoguanine DNA-glycosylase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Mmh | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
8-oxoguanine DNA-glycosylase 1
8-oxoguanine DNA-glycosylase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000114026:
This gene encodes the enzyme responsible for the excision of 8-oxoguanine, a mutagenic base byproduct which occurs as a result of exposure to reactive oxygen. The action of this enzyme includes lyase activity for chain cleavage. Alternative splicing of the C-terminal region of this gene classifies splice variants into two major groups, type 1 and type 2, depending on the last exon of the sequence. Type 1 alternative splice variants end with exon 7 and type 2 end with exon 8. All variants share the N-terminal region in common, which contains a mitochondrial targeting signal that is essential for mitochondrial localization. Many alternative splice variants for this gene have been described, but the full-length nature for every variant has not been determined. [provided by RefSeq, Aug 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:113326972-113335068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Base-free sugar-phosphate removal via the single-nucleotide replacement pathway pathway
Displacement of DNA glycosylase by APE1 pathway
Resolution of AP sites via the single-nucleotide replacement pathway pathway
Base Excision Repair pathway
Base-Excision Repair, AP Site Formation pathway
Resolution of AP sites via the multiple-nucleotide patch replacement pathway pathway
Depurination pathway
DNA Repair pathway
Removal of DNA patch containing abasic residue pathway
Cleavage of the damaged purine pathway
Resolution of Abasic Sites (AP sites) pathway
Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected purine pathway
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KEGG |
Base excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Displacement of DNA glycosylase by APE1 pathway
Base-free sugar-phosphate removal via the single-nucleotide replacement pathway pathway
Resolution of AP sites via the single-nucleotide replacement pathway pathway
Removal of DNA patch containing abasic residue pathway
Resolution of AP sites via the multiple-nucleotide patch replacement pathway pathway
Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected purine pathway
Cleavage of the damaged purine pathway
Resolution of Abasic Sites (AP sites) pathway
Base Excision Repair pathway
Base-Excision Repair, AP Site Formation pathway
Depurination pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Base excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated transcriptional targets of TAp63 isoforms
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3UVT7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.43612 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1097693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ogg1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC155287 CH466523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | EDK99451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 18294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||