Homo sapiens Gene: OGG1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15945.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | OGG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | 8-oxoguanine DNA glycosylase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HMMH; HOGG1; MUTM; OGH1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000114026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
8-oxoguanine DNA glycosylase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes the enzyme responsible for the excision of 8-oxoguanine, a mutagenic base byproduct which occurs as a result of exposure to reactive oxygen. The action of this enzyme includes lyase activity for chain cleavage. Alternative splicing of the C-terminal region of this gene classifies splice variants into two major groups, type 1 and type 2, depending on the last exon of the sequence. Type 1 alternative splice variants end with exon 7 and type 2 end with exon 8. All variants share the N-terminal region in common, which contains a mitochondrial targeting signal that is essential for mitochondrial localization. Many alternative splice variants for this gene have been described, but the full-length nature for every variant has not been determined. [provided by RefSeq, Aug 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:9749944-9788219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p25.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Displacement of DNA glycosylase by APE1 pathway
Base-free sugar-phosphate removal via the single-nucleotide replacement pathway pathway
Resolution of AP sites via the single-nucleotide replacement pathway pathway
Removal of DNA patch containing abasic residue pathway
Resolution of AP sites via the multiple-nucleotide patch replacement pathway pathway
Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected purine pathway
Cleavage of the damaged purine pathway
Resolution of Abasic Sites (AP sites) pathway
Base Excision Repair pathway
Base-Excision Repair, AP Site Formation pathway
Depurination pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Base excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated transcriptional targets of TAp63 isoforms
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.380271 Hs.736214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002542 NM_016819 NM_016820 NM_016821 NM_016826 NM_016827 NM_016828 NM_016829 XM_005265185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2576 CCDS2577 CCDS2578 CCDS2579 CCDS2580 CCDS2581 CCDS43046 CCDS46742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||