Mus musculus Gene: Vps35 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-177013.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vps35 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | vacuolar protein sorting 35 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI647796; Mem3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031696 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 35
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000069329:
This gene belongs to a group of vacuolar protein sorting (VPS) genes. The encoded protein is a component of a large multimeric complex, termed the retromer complex, involved in retrograde transport of proteins from endosomes to the trans-Golgi network. The close structural similarity between the yeast and human proteins that make up this complex suggests a similarity in function. Expression studies in yeast and mammalian cells indicate that this protein interacts directly with VPS35, which serves as the core of the retromer complex. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:85260397-85299513 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 48 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Disease pathway
Signaling by Wnt pathway
WNT ligand biogenesis and trafficking pathway
Signaling by WNT in cancer pathway
WNT ligand secretion is abrogated by the PORCN inhibitor LGK974 pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Signaling by WNT in cancer pathway
Signaling by Wnt pathway
WNT ligand secretion is abrogated by the PORCN inhibitor LGK974 pathway
Signal Transduction pathway
WNT ligand biogenesis and trafficking pathway
Disease pathway
Signaling by Wnt pathway
Signaling by WNT in cancer pathway
WNT ligand biogenesis and trafficking pathway
WNT ligand secretion is abrogated by the PORCN inhibitor LGK974 pathway
Signal Transduction pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.296520 Mm.391632 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_022997 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40421 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||