Mus musculus Gene: Rb1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179829.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rb1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | retinoblastoma 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | pRb; Rb; Rb-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
retinoblastoma 1
retinoblastoma 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Rb1 positively regulates Tlr3 expression by modulating the transcription factor E2f1.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] RB1 positively regulates TLR3 expression by modulating the transcription factor E2F1. (Demonstrated in mice)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000139687:
The protein encoded by this gene is a negative regulator of the cell cycle and was the first tumor suppressor gene found. The encoded protein also stabilizes constitutive heterochromatin to maintain the overall chromatin structure. The active, hypophosphorylated form of the protein binds transcription factor E2F1. Defects in this gene are a cause of childhood cancer retinoblastoma (RB), bladder cancer, and osteogenic sarcoma. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:73183673-73325822 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 59 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 228 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell Cycle, Mitotic pathway
G1 Phase pathway
Synthesis of DNA pathway
Inhibition of replication initiation of damaged DNA by RB1/E2F1 pathway
DNA Replication pathway
Switching of origins to a post-replicative state pathway
Cellular responses to stress pathway
Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Cyclin D associated events in G1 pathway
Condensation of Prophase Chromosomes pathway
Phosphorylation of proteins involved in G1/S transition by active Cyclin E:Cdk2 complexes pathway
Regulation of DNA replication pathway
Cellular Senescence pathway
Orc1 removal from chromatin pathway
G1/S Transition pathway
Removal of licensing factors from origins pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
E2F mediated regulation of DNA replication pathway
Mitotic Prophase pathway
Cyclin E associated events during G1/S transition pathway
S Phase pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Bladder cancer pathway
Melanoma pathway
Cell cycle pathway
Glioma pathway
Small cell lung cancer pathway
Prostate cancer pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Non-small cell lung cancer pathway
Pancreatic cancer pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
ID pathway
TGF_beta_Receptor pathway
TNFalpha pathway
BCR pathway
IL1 pathway
IL3 pathway
IL6 pathway
TSH pathway
Prolactin pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Orc1 removal from chromatin pathway
Removal of licensing factors from origins pathway
Switching of origins to a post-replicative state pathway
Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry pathway
Phosphorylation of proteins involved in G1/S transition by active Cyclin E:Cdk2 complexes pathway
Cyclin E associated events during G1/S transition pathway
Inhibition of replication initiation of damaged DNA by RB1/E2F1 pathway
E2F mediated regulation of DNA replication pathway
Cyclin D associated events in G1 pathway
DNA Replication pathway
G1 Phase pathway
Cellular responses to stress pathway
Synthesis of DNA pathway
Condensation of Prophase Chromosomes pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
S Phase pathway
G1/S Transition pathway
Cell Cycle pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
M Phase pathway
Cellular Senescence pathway
Mitotic Prophase pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Regulation of DNA replication pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Non-small cell lung cancer pathway
Cell cycle pathway
Melanoma pathway
Bladder cancer pathway
Glioma pathway
Small cell lung cancer pathway
Prostate cancer pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Pancreatic cancer pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of retinoblastoma protein
Direct p53 effectors
ATF-2 transcription factor network
Notch-mediated HES/HEY network
p73 transcription factor network
E2F transcription factor network
FOXM1 transcription factor network
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.273862 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27267 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||