Homo sapiens Gene: SEC13 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-18046.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEC13 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | SEC13 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | D3S1231E; npp-20; SEC13L1; SEC13R | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000157020 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SEC13 homolog (S. cerevisiae)
SEC13 homolog (S. cerevisiae)
SEC13 homolog (S. cerevisiae)
SEC13 homolog (S. cerevisiae)
SEC13 homolog (S. cerevisiae)
SEC13 homolog (S. cerevisiae)
SEC13 homolog (S. cerevisiae)
SEC13 homolog (S. cerevisiae)
SEC13 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene belongs to the SEC13 family of WD-repeat proteins. It is a constituent of the endoplasmic reticulum and the nuclear pore complex. It has similarity to the yeast SEC13 protein, which is required for vesicle biogenesis from endoplasmic reticulum during the transport of proteins. Multiple alternatively spliced transcript variants have been found. [provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:10293131-10321178 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p25.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 38 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Resolution of Sister Chromatid Cohesion pathway
Mitotic Prometaphase pathway
Separation of Sister Chromatids pathway
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC pathway
MHC class II antigen presentation pathway
COPII (Coat Protein 2) Mediated Vesicle Transport pathway
Transport to the Golgi and subsequent modification pathway
Asparagine N-linked glycosylation pathway
Post-translational protein modification pathway
ER to Golgi Transport pathway
Cell Cycle pathway
Metabolism of proteins pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
M Phase pathway
Mitotic Anaphase pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Membrane Trafficking pathway
Mitotic Metaphase and Anaphase pathway
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KEGG |
RNA transport pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.166924 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001136026 NM_001136232 NM_030673 NM_183352 XM_005265378 XM_005265379 XM_006713286 XM_006713287 XM_006713288 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2599 CCDS46751 CCDS63540 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02538 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||