Version 5.4
| Homo sapiens Gene: PRPF40B | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-31710.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | PRPF40B | ||||||||||||||||||
| Gene Name | PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | HYPC | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000110844 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (S. cerevisiae)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (S. cerevisiae)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (S. cerevisiae)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (S. cerevisiae)
PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (S. cerevisiae)
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene encodes a WW-domain containing protein similar to yeast splicing factor PRP40. This protein has been shown to interact with Huntingtin and MeCP2. Alternative splicing results in different transcriptional variants. [provided by RefSeq, Jun 2012] This gene encodes a WW-domain containing protein similar to yeast splicing factor PRP40. This protein has been shown to interact with Huntingtin and methyl CpG binding protein 2 (MeCP2). Alternative splicing results in different transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2014] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 12:49568218-49644666 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | q13.12 | ||||||||||||||||||
| Transcripts | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME | |||||||||||||||||||
| KEGG |
Spliceosome pathway
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| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.608293 Hs.674361 Hs.706827 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001031698 NM_012272 XM_006719324 XM_006719326 XM_006719327 XM_006719328 XM_006719329 XM_006719330 | ||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS31796 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 11044 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||