Mus musculus Gene: Pdlim5 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-197000.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pdlim5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PDZ and LIM domain 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110001A05Rik; AI987914; C87059; Enh; Enh1; Enh2; Enh3; LIM | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028273 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000163110:
This gene encodes a member of a family of proteins that possess a 100-amino acid PDZ domain at the N terminus and one to three LIM domains at the C-terminus. This family member functions as a scaffold protein that tethers protein kinases to the Z-disk in striated muscles. It is thought to function in cardiomyocyte expansion and in restraining postsynaptic growth of excitatory synapses. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2012] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:142239586-142395696 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | H1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
|
||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D9J303 E9Q8P5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56376 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.405526 Mm.409710 Mm.413081 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001190857 NM_022554 XM_006501750 XM_006501751 NM_001190853 NM_001190854 NM_001190855 NM_001190856 NM_019808 NM_019809 XM_006501748 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38656 CCDS17875 CCDS17876 CCDS57258 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1927489 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pdlim5 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC139128 AC158581 HM369798 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | ADI88508 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 56376 | ||||||||||||||||||||||