Homo sapiens Gene: PDLIM5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-30475.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDLIM5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PDZ and LIM domain 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ENH; ENH1; LIM | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000163110 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
PDZ and LIM domain 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of a family of proteins that possess a 100-amino acid PDZ domain at the N terminus and one to three LIM domains at the C-terminus. This family member functions as a scaffold protein that tethers protein kinases to the Z-disk in striated muscles. It is thought to function in cardiomyocyte expansion and in restraining postsynaptic growth of excitatory synapses. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:94451857-94668227 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q22.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001011513 NM_001011515 NM_001011516 NM_001256425 NM_001256426 NM_001256427 NM_001256428 NM_001256429 NM_006457 XM_005262693 XM_005262695 XM_005262696 XM_005262698 XM_006714066 XM_006714067 XM_006714068 XM_006714069 XM_006714070 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3641 CCDS47103 CCDS47104 CCDS58915 CCDS58916 CCDS58917 CCDS75166 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05799 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||