Mus musculus Gene: Rnf123 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-199020.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rnf123 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein 123 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BC003945; Kpc1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000041528 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ring finger protein 123
ring finger protein 123
ring finger protein 123
ring finger protein 123
ring finger protein 123
ring finger protein 123
ring finger protein 123
ring finger protein 123
ring finger protein 123
ring finger protein 123
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000164068:
The protein encoded by this gene contains a C-terminal RING finger domain, a motif present in a variety of functionally distinct proteins and known to be involved in protein-protein and protein-DNA interactions, and an N-terminal SPRY domain. This protein displays E3 ubiquitin ligase activity toward the cyclin-dependent kinase inhibitor 1B which is also known as p27 or KIP1. [provided by RefSeq, Feb 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:108051534-108083346 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Immune System pathway
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F6U715 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 84585 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.379272 Mm.488389 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_032543 XM_006511877 XM_006511878 XM_006511879 XM_006511880 XM_006511882 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS52922 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2148796 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rnf123 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC137678 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 84585 | ||||||||||||||||||||||