Mus musculus Gene: Scarb1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-201281.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Scarb1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | scavenger receptor class B, member 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI120173; CD36; Cd36l1; Cla-1; Cla1; D5Ertd460e; Hdlq1; Hlb398; mSR-BI; SR-B1; SR-BI; Srb1; SRBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000037936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
scavenger receptor class B, member 1
scavenger receptor class B, member 1
scavenger receptor class B, member 1
scavenger receptor class B, member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Scarb1 regulates the macrophage inflammatory response to LPS.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] SCARB1 regulates the macrophage inflammatory response to LPS. (Demonstrated in mice)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000073060:
The protein encoded by this gene is a plasma membrane receptor for high density lipoprotein cholesterol (HDL). The encoded protein mediates cholesterol transfer to and from HDL. In addition, this protein is a receptor for hepatitis C virus glycoprotein E2. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:125277087-125341094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | G1.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDL-mediated lipid transport pathway
Metabolism pathway
Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
Lipoprotein metabolism pathway
Scavenging by Class B Receptors pathway
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KEGG |
Phagosome pathway
Bile secretion pathway
Hepatitis C pathway
Fat digestion and absorption pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Lipoprotein metabolism pathway
HDL-mediated lipid transport pathway
Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
Scavenging by Class B Receptors pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
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KEGG |
Fat digestion and absorption pathway
Bile secretion pathway
Phagosome pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.282242 Mm.474018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205082 NM_001205083 NM_016741 XM_006504286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19683 CCDS57383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||