Mus musculus Gene: Clcnka | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-202042.6 | ||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||
Gene Symbol | Clcnka | ||||||||||||||||
Gene Name | chloride channel Ka | ||||||||||||||||
Synonyms | C75963; CLC-K1; Clcnk1 | ||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000033770 | ||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chloride channel Ka
chloride channel Ka
chloride channel Ka
|
||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the CLC family of voltage-gated chloride channels. The gene is located adjacent to a highly similar chloride channel gene on chromosome 4. This gene is syntenic with human CLCNKB (geneID:1188). Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009] |
||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:141384610-141398724 | ||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Ion channel transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
|
||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Ion channel transport pathway
|
||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||
UniGene | Mm.167900 | ||||||||||||||||
RefSeq | NM_001146307 NM_024412 | ||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||
CCDS | CCDS18871 | ||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||