Mus musculus Gene: Ngfr | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-209608.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ngfr | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nerve growth factor receptor (TNFR superfamily, member 16) | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LNGFR; p75; p75NGFR; p75NTR; Tnfrsf16 | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000000120 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nerve growth factor receptor (TNFR superfamily, member 16)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000064300:
Nerve growth factor receptor contains an extracellular domain containing four 40-amino acid repeats with 6 cysteine residues at conserved positions followed by a serine/threonine-rich region, a single transmembrane domain, and a 155-amino acid cytoplasmic domain. The cysteine-rich region contains the nerve growth factor binding domain. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:95568818-95587735 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | D | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 39 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Axonal growth stimulation pathway
Axonal growth inhibition (RHOA activation) pathway
Regulated proteolysis of p75NTR pathway
p75NTR recruits signalling complexes pathway
NF-kB is activated and signals survival pathway
Ceramide signalling pathway
p75NTR negatively regulates cell cycle via SC1 pathway
NRIF signals cell death from the nucleus pathway
NADE modulates death signalling pathway
NRAGE signals death through JNK pathway
NFG and proNGF binds to p75NTR pathway
Signalling by NGF pathway
p75NTR regulates axonogenesis pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
p75NTR signals via NF-kB pathway
Signal Transduction pathway
Cell death signalling via NRAGE, NRIF and NADE pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
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INOH |
IL-7 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
EPO signaling pathway pathway
VEGF signaling pathway pathway
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PID NCI |
Neurotrophic factor-mediated Trk receptor signaling
p75(NTR)-mediated signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8BYY1 Q8CFT3 S5MVZ3 W8QQI5 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18053 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.283893 Mm.406193 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_033217 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25279 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:97323 | ||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ngfr | ||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK037248 AL662875 BC038365 CH466556 KC855565 KF982304 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH38365 AGR50956 AHL58823 BAC29775 EDL15985 | ||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 18053 | ||||||||||||||||||||||||||||