Mus musculus Gene: Cd40 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-212533.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cd40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | CD40 antigen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI326936; Bp50; GP39; HIGM1; IGM; IMD3; p50; T-BAM; Tnfrsf5; TRAP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000017652 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CD40 antigen
CD40 antigen
CD40 antigen
CD40 antigen
CD40 antigen
CD40 antigen
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Tmem126a upregulates genes involved in antigen presentation; such as Icam1, MHC II, Cd86 and Cd40, via the Tlr4 signal transduction pathway.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000101017:
The protein encoded by this gene is a member of the TNF-receptor superfamily. This receptor has been found to be essential in mediating a broad variety of immune and inflammatory responses including T cell-dependent immunoglobulin class switching, memory B cell development, and germinal center formation. AT-hook transcription factor AKNA is reported to coordinately regulate the expression of this receptor and its ligand, which may be important for homotypic cell interactions. Adaptor protein TNFR2 interacts with this receptor and serves as a mediator of the signal transduction. The interaction of this receptor and its ligand is found to be necessary for amyloid-beta-induced microglial activation, and thus is thought to be an early event in Alzheimer disease pathogenesis. Two alternatively spliced transcript variants of this gene encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:165055627-165072948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | H3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 48 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 55 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell pathway
Immune System pathway
Adaptive Immune System pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Toll-like receptor signaling pathway pathway
Asthma pathway
Allograft rejection pathway
Systemic lupus erythematosus pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
Primary immunodeficiency pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
Viral myocarditis pathway
Malaria pathway
Toxoplasmosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
IL4 pathway
IL6 pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Toll-like receptor signaling pathway pathway
Allograft rejection pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
Systemic lupus erythematosus pathway
Primary immunodeficiency pathway
Asthma pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
Viral myocarditis pathway
Malaria pathway
Toxoplasmosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
CD40/CD40L signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | S4R2M8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011611 NM_170702 NM_170703 NM_170704 XM_006499153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17069 CCDS17070 CCDS17071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:88336 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cd40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL591411 AL591495 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 21939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||