Mus musculus Gene: Chrna4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-213951.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Chrna4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Acra-4; Acra4; EBN1; ENFL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 4
cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 4
cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 4
cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000101204:
This gene encodes a nicotinic acetylcholine receptor, which belongs to a superfamily of ligand-gated ion channels that play a role in fast signal transmission at synapses. These pentameric receptors can bind acetylcholine, which causes an extensive change in conformation that leads to the opening of an ion-conducting channel across the plasma membrane. This protein is an integral membrane receptor subunit that can interact with either nAChR beta-2 or nAChR beta-4 to form a functional receptor. Mutations in this gene cause nocturnal frontal lobe epilepsy type 1. Polymorphisms in this gene that provide protection against nicotine addiction have been described. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:181018380-181043546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | H4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
Presynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Highly sodium permeable acetylcholine nicotinic receptors pathway
Neuronal System pathway
Activation of Nicotinic Acetylcholine Receptors pathway
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Acetylcholine Binding And Downstream Events pathway
Postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Neuronal System pathway
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors pathway
Postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Highly sodium permeable acetylcholine nicotinic receptors pathway
Activation of Nicotinic Acetylcholine Receptors pathway
Presynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
Acetylcholine Binding And Downstream Events pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O70174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q53YK0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 11438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.252369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_015730 XM_006500551 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:87888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Chrna4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB010002 AF225912 AF325347 AK034228 AK083157 AK136886 AK143938 AY574263 BC053013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF34716 AAH53013 AAL37363 AAS90359 BAA25752 BAC28638 BAC38788 BAE23155 BAE25619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 11438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||