Mus musculus Gene: Pja1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-215384.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pja1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | praja1, RING-H2 motif containing | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | praja-1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000034403 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
praja1, RING-H2 motif containing
praja1, RING-H2 motif containing
praja1, RING-H2 motif containing
praja1, RING-H2 motif containing
praja1, RING-H2 motif containing
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000181191:
This gene encodes an enzyme that has E2-dependent E3 ubiquitin-protein ligase activity. This enzyme belongs to a class of ubiquitin ligases that include a RING finger motif, and it can interact with the E2 ubiquitin-conjugating enzyme UbcH5B. This gene is located in an area of chromosome X where several X-linked mental retardation disorders have been associated, and it has also been found as part of a contiguous gene deletion associated with craniofrontonasal syndrome, though a direct link to any disorder has yet to be demonstrated. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:99465734-99471273 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 36 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Immune System pathway
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B1AXU4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18744 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.415536 Mm.8211 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001290556 XM_006527898 NM_001083110 NM_008853 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41070 CCDS41071 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1101765 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pja1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AL831752 CH466564 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | EDL14193 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 18744 | ||||||||||||||||||||||