Homo sapiens Gene: GPBP1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-22387.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GPBP1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | GC-rich promoter binding protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000062194 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
GC-rich promoter binding protein 1
GC-rich promoter binding protein 1
GC-rich promoter binding protein 1
GC-rich promoter binding protein 1
GC-rich promoter binding protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene was originally isolated by subtractive hybridization of cDNAs expressed in atherosclerotic plaques with a thrombus, and was found to be expressed only in vascular smooth muscle cells. However, a shorter splice variant was found to be more ubiquitously expressed. This protein is suggested to play a role in the development of atherosclerosis. Studies in mice suggest that it may also function as a GC-rich promoter-specific trans-activating transcription factor. Several alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:57173948-57264679 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q11.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.444279 Hs.694984 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001127235 NM_001127236 NM_001203246 NM_022913 XM_005248571 XM_005248572 XM_005248573 XM_005248574 XM_006714673 XM_006714674 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34162 CCDS47211 CCDS47212 CCDS56368 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16333 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||