Homo sapiens Gene: IRF9 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-236583.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IRF9 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon regulatory factor 9 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000213928 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon regulatory factor 9
interferon regulatory factor 9
interferon regulatory factor 9
interferon regulatory factor 9
interferon regulatory factor 9
interferon regulatory factor 9
interferon regulatory factor 9
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
IRF9 is a DNA-binding protein that is a member of the alpha-interferon-induced ISGF3 complex. Bipartite complexes of STAT2:IRF9 and STAT2:STAT1 translocate to the nucleus and associate on DNA target sites as ISGF3.
IRF9 functions to recruit RNA polymerase II to the promoter of interferon (IFN)-stimulated genes and this function of IRF9 requires the activity of histone deacetylases.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:24161053-24166565 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q12 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 62 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
Interferon gamma signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Jak-STAT signaling pathway pathway
Osteoclast differentiation pathway
Hepatitis C pathway
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INOH |
IFN alpha signaling pathway
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PID NCI |
IFN-gamma pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.1706 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_006084 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9615 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 00960 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||