Homo sapiens Gene: EXOSC8 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24717.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | EXOSC8 | ||||||||||||||||||
Gene Name | exosome component 8 | ||||||||||||||||||
Synonyms | bA421P11.3; CIP3; EAP2; OIP2; p9; RRP43; Rrp43p | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000120699 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
exosome component 8
exosome component 8
exosome component 8
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a 3'-5' exoribonuclease that specifically interacts with mRNAs containing AU-rich elements. The encoded protein is part of the exosome complex that is important for the degradation of numerous RNA species. A pseudogene of this gene is found on chromosome 6. [provided by RefSeq, Mar 2009] This gene encodes a 3\'-5\' exoribonuclease that specifically interacts with mRNAs containing AU-rich elements. The encoded protein is part of the exosome complex that is important for the degradation of numerous RNA species. A pseudogene of this gene is found on chromosome 6. [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:36998816-37009613 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q13.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 44 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Butyrate Response Factor 1 (BRF1) destabilizes mRNA pathway
Tristetraprolin (TTP) destabilizes mRNA pathway
KSRP destabilizes mRNA pathway
mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease pathway
ATF4 activates genes pathway
PERK regulates gene expression pathway
Unfolded Protein Response (UPR) pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Metabolism of proteins pathway
Regulation of mRNA stability by proteins that bind AU-rich elements pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.294041 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_181503 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31958 | ||||||||||||||||||
HPRD | 09351 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||