Homo sapiens Gene: CPSF3 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-27627.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CPSF3 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cleavage and polyadenylation specific factor 3, 73kDa | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000119203 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cleavage and polyadenylation specific factor 3, 73kDa
cleavage and polyadenylation specific factor 3, 73kDa
cleavage and polyadenylation specific factor 3, 73kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the metallo-beta-lactamase family. The encoded protein is a 73kDa subunit of the cleavage and polyadenylation specificity factor and functions as an endonuclease that recognizes the pre-mRNA 3'-cleavage site AAUAAA prior to polyadenylation. It also cleaves after the pre-mRNA sequence ACCCA during histone 3'-end pre-mRNA processing. [provided by RefSeq, Oct 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:9423568-9473101 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | p25.1 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 43 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Processing of Intronless Pre-mRNAs pathway
mRNA 3'-end processing pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Transport of Mature mRNA Derived from an Intronless Transcript pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region pathway
RNA Polymerase II Transcription Termination pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
Transport of Mature Transcript to Cytoplasm pathway
Processing of Capped Intronless Pre-mRNA pathway
Transport of Mature mRNAs Derived from Intronless Transcripts pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.515972 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016207 XM_005246167 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1664 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05825 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||