Homo sapiens Gene: AKAP13 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-28095.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | AKAP13 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | A kinase (PRKA) anchor protein 13 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AKAP-13; AKAP-Lbc; ARHGEF13; BRX; c-lbc; HA-3; Ht31; LBC; p47; PRKA13; PROTO-LB; PROTO-LBC | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000170776 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
A kinase (PRKA) anchor protein 13
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The A-kinase anchor proteins (AKAPs) are a group of structurally diverse proteins which have the common function of binding to the regulatory subunit of protein kinase A (PKA) and confining the holoenzyme to discrete locations within the cell. This gene encodes a member of the AKAP family. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding different isoforms containing c-terminal dbl oncogene homology (DH) and pleckstrin homology (PH) domains. The DH domain is associated with guanine nucleotide exchange activation for the Rho/Rac family of small GTP binding proteins, resulting in the conversion of the inactive GTPase to the active form capable of transducing signals. The PH domain has multiple functions. Therefore, these isoforms function as scaffolding proteins to coordinate a Rho signaling pathway, function as protein kinase A-anchoring proteins and, in addition, enhance ligand-dependent activity of estrogen receptors alpha and beta. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:85380571-85749358 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q25.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 29 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
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REACTOME |
NRAGE signals death through JNK pathway
G alpha (12/13) signalling events pathway
Rho GTPase cycle pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by Rho GTPases pathway
Signaling by GPCR pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
Cell death signalling via NRAGE, NRIF and NADE pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
PAR1-mediated thrombin signaling events
Regulation of RhoA activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.459211 Hs.608041 Hs.608755 Hs.619023 Hs.741394 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001270546 NM_006738 NM_007200 XM_005254846 XM_005254847 XM_005254848 XM_005254854 XM_005254855 XM_005254856 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32319 CCDS32320 CCDS73778 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05253 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||