Homo sapiens Gene: CARM1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-28472.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CARM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | coactivator-associated arginine methyltransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | PRMT4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000142453 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
coactivator-associated arginine methyltransferase 1
coactivator-associated arginine methyltransferase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Protein arginine N-methyltransferases, such as CARM1, catalyze the transfer of a methyl group from S-adenosyl-L-methionine to the side chain nitrogens of arginine residues within proteins to form methylated arginine derivatives and S-adenosyl-L-homocysteine. Protein arginine methylation has been implicated in signal transduction, metabolism of nascent pre-RNA, and transcriptional activation (Frankel et al., 2002 [PubMed 11724789]).[supplied by OMIM, Mar 2008] This gene belongs to the protein arginine methyltransferase (PRMT) family. The encoded enzyme catalyzes the methylation of guanidino nitrogens of arginyl residues of proteins. The enzyme acts specifically on histones and other chromatin-associated proteins and is involved in regulation of gene expression. The enzyme may act in association with other proteins or within multi-protein complexes and may play a role in cell type-specific functions and cell lineage specification. A related pseudogene is located on chromosome 9. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:10871513-10923070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 106 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Developmental Biology pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Orphan transporters pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Chromatin organization pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Metabolism pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Coregulation of Androgen receptor activity
Direct p53 effectors
Regulation of Androgen receptor activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7EK20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.323213 Hs.734431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_199141 XM_005259708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:23393 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12250 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09158 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC007565 AC011442 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||