Homo sapiens Gene: LIMA1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-32504.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LIMA1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | LIM domain and actin binding 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000050405 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
LIM domain and actin binding 1
LIM domain and actin binding 1
LIM domain and actin binding 1
LIM domain and actin binding 1
LIM domain and actin binding 1
LIM domain and actin binding 1
LIM domain and actin binding 1
LIM domain and actin binding 1
LIM domain and actin binding 1
LIM domain and actin binding 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a cytoskeleton-associated protein that inhibits actin filament depolymerization and cross-links filaments in bundles. It is downregulated in some cancer cell lines. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene, and expression of some of the variants maybe independently regulated. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:50175788-50283546 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.12 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 30 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Stabilization and expansion of the E-cadherin adherens junction
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.525419 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001113546 NM_001113547 NM_001243775 NM_016357 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44877 CCDS55826 CCDS58230 CCDS8802 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09755 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||