Homo sapiens Gene: LSM4 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-37991.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | LSM4 | ||||||||||||||||||
Gene Name | LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | GRP; YER112W | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000130520 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the LSm family of RNA-binding proteins. LSm proteins form stable heteromers that bind specifically to the 3'-terminal oligo(U) tract of U6 snRNA and may play a role in pre-mRNA splicing by mediating U4/U6 snRNP formation. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011] This gene encodes a member of the LSm family of RNA-binding proteins. LSm proteins form stable heteromers that bind specifically to the 3\'-terminal oligo(U) tract of U6 snRNA and may play a role in pre-mRNA splicing by mediating U4/U6 snRNP formation. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:18306230-18323274 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p13.11 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 60 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.515255 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001252129 NM_012321 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12374 CCDS62601 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06284 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||