Homo sapiens Gene: PDE1B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-38149.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDE1B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | phosphodiesterase 1B, calmodulin-dependent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | PDE1B1; PDES1B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000123360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
phosphodiesterase 1B, calmodulin-dependent
phosphodiesterase 1B, calmodulin-dependent
phosphodiesterase 1B, calmodulin-dependent
phosphodiesterase 1B, calmodulin-dependent
phosphodiesterase 1B, calmodulin-dependent
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene belongs to the cyclic nucleotide phosphodiesterase (PDE) family, and PDE1 subfamily. Members of the PDE1 family are calmodulin-dependent PDEs that are stimulated by a calcium-calmodulin complex. This PDE has dual-specificity for the second messengers, cAMP and cGMP, with a preference for cGMP as a substrate. cAMP and cGMP function as key regulators of many important physiological processes. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene.[provided by RefSeq, Jul 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:54549350-54579239 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cam-PDE 1 activation pathway
Calmodulin induced events pathway
CaM pathway pathway
DAG and IP3 signaling pathway
DAP12 signaling pathway
DAP12 interactions pathway
cGMP effects pathway
Nitric oxide stimulates guanylate cyclase pathway
Platelet homeostasis pathway
PLC-gamma1 signalling pathway
EGFR interacts with phospholipase C-gamma pathway
Signaling by EGFR pathway
G alpha (s) signalling events pathway
PLC beta mediated events pathway
Opioid Signalling pathway
PLCG1 events in ERBB2 signaling pathway
Signaling by ERBB2 pathway
Phospholipase C-mediated cascade pathway
Signaling by FGFR pathway
Downstream signal transduction pathway
Signaling by PDGF pathway
Signaling by FGFR in disease pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by EGFR in Cancer pathway
Downstream signaling of activated FGFR pathway
Signaling by GPCR pathway
Innate Immune System pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
G-protein mediated events pathway
Immune System pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
Ca-dependent events pathway
Disease pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Purine metabolism pathway
Calcium signaling pathway pathway
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INOH |
Purine nucleotides nucleosides metabolism pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.530871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000924 NM_001165975 NM_001288768 NM_001288769 XM_006719451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS53800 CCDS73477 CCDS8882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||