Homo sapiens Gene: CDK5R1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-40195.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CDK5R1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CDK5P35; CDK5R; NCK5A; p23; p25; p35; p35nck5a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000176749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene (p35) is a neuron-specific activator of cyclin-dependent kinase 5 (CDK5); the activation of CDK5 is required for proper development of the central nervous system. The p35 form of this protein is proteolytically cleaved by calpain, generating a p25 form. The cleavage of p35 into p25 results in relocalization of the protein from the cell periphery to nuclear and perinuclear regions. P25 deregulates CDK5 activity by prolonging its activation and changing its cellular location. The p25 form accumulates in the brain neurons of patients with Alzheimer's disease. This accumulation correlates with an increase in CDK5 kinase activity, and may lead to aberrantly phosphorylated forms of the microtubule-associated protein tau, which contributes to Alzheimer's disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene (p35) is a neuron-specific activator of cyclin-dependent kinase 5 (CDK5); the activation of CDK5 is required for proper development of the central nervous system. The p35 form of this protein is proteolytically cleaved by calpain, generating a p25 form. The cleavage of p35 into p25 results in relocalization of the protein from the cell periphery to nuclear and perinuclear regions. P25 deregulates CDK5 activity by prolonging its activation and changing its cellular location. The p25 form accumulates in the brain neurons of patients with Alzheimer\'s disease. This accumulation correlates with an increase in CDK5 kinase activity, and may lead to aberrantly phosphorylated forms of the microtubule-associated protein tau, which contributes to Alzheimer\'s disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:32486619-32491256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q11.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 37 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
CRMPs in Sema3A signaling pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Alzheimer's disease pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Trk receptor signaling mediated by the MAPK pathway
Reelin signaling pathway
Glucocorticoid receptor regulatory network
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.500015 Hs.662611 Hs.714132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003885 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||