Homo sapiens Gene: PEG10 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-409089.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PEG10 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | paternally expressed 10 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | EDR; HB-1; Mar2; Mart2; MEF3L; RGAG3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000242265 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
paternally expressed 10
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This is a paternally expressed imprinted gene that encodes transcripts containing two overlapping open reading frames (ORFs), RF1 and RF1/RF2, as well as retroviral-like slippage and pseudoknot elements, which can induce a -1 nucleotide frame-shift. ORF1 encodes a shorter isoform with a CCHC-type zinc finger motif containing a sequence characteristic of gag proteins of most retroviruses and some retrotransposons. The longer isoform is the result of -1 translational frame-shifting leading to translation of a gag/pol-like protein combining RF1 and RF2. It contains the active-site consensus sequence of the protease domain of pol proteins. Additional isoforms resulting from alternatively spliced transcript variants, as well as from use of upstream non-AUG (CUG) start codon, have been reported for this gene. Increased expression of this gene is associated with hepatocellular carcinomas. [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:94656325-94669695 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 30 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated targets of C-MYC transcriptional activation
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23089 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001184962 NM_001040152 NM_001172437 NM_001172438 NM_001184961 NM_015068 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14005 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 609810 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS75637 CCDS55126 CCDS75636 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 23089 | ||||||||||||||||||||||