Homo sapiens Gene: HERC2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4485.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HERC2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | D15F37S1; jdf2; MRT38; p528; SHEP1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000128731 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
hect domain and RLD 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene belongs to the HERC gene family that encodes a group of unusually large proteins, which contain multiple structural domains. All members have at least 1 copy of an N-terminal region showing homology to the cell cycle regulator RCC1 and a C-terminal HECT (homologous to E6-AP C terminus) domain found in a number of E3 ubiquitin protein ligases. Genetic variations in this gene are associated with skin/hair/eye pigmentation variability. Multiple pseudogenes of this gene are located on chromosomes 15 and 16. [provided by RefSeq, Mar 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:28111040-28322152 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 58 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG |
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.434890 Hs.655872 Hs.722313 Hs.722755 Hs.741019 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004667 XM_005268276 XM_005268277 XM_006720726 XM_006720727 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10021 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06905 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||