Homo sapiens Gene: PDLIM3 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-47012.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDLIM3 | ||||||||||||||||||
Gene Name | PDZ and LIM domain 3 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000154553 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PDZ and LIM domain 3
PDZ and LIM domain 3
PDZ and LIM domain 3
PDZ and LIM domain 3
PDZ and LIM domain 3
PDZ and LIM domain 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene contains a PDZ domain and a LIM domain, indicating that it may be involved in cytoskeletal assembly. In support of this, the encoded protein has been shown to bind the spectrin-like repeats of alpha-actinin-2 and to colocalize with alpha-actinin-2 at the Z lines of skeletal muscle. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. Aberrant alternative splicing of this gene may play a role in myotonic dystrophy. [provided by RefSeq, Apr 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:185500660-185535612 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q35.1 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.731826 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001114107 NM_001257962 NM_001257963 NM_014476 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3844 CCDS47172 CCDS75218 CCDS75219 | ||||||||||||||||||
HPRD | 08388 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||