Homo sapiens Gene: LRPPRC | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-49387.7 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LRPPRC | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | leucine-rich pentatricopeptide repeat containing | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CLONE-23970; GP130; LRP130; LSFC | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000138095 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
leucine-rich PPR-motif containing
leucine-rich PPR-motif containing
leucine-rich PPR-motif containing
leucine-rich PPR-motif containing
leucine-rich PPR-motif containing
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a leucine-rich protein that has multiple pentatricopeptide repeats (PPR). The precise role of this protein is unknown but studies suggest it may play a role in cytoskeletal organization, vesicular transport, or in transcriptional regulation of both nuclear and mitochondrial genes. The protein localizes primarily to mitochondria and is predicted to have an N-terminal mitochondrial targeting sequence. Mutations in this gene are associated with the French-Canadian type of Leigh syndrome. [provided by RefSeq, Mar 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:43886508-43996005 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | p21 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 79 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Respiratory electron transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Respiratory electron transport, ATP synthesis by chemiosmotic coupling, and heat production by uncoupling proteins. pathway
Orphan transporters pathway
The citric acid (TCA) cycle and respiratory electron transport pathway
Metabolism pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.368084 Hs.635473 Hs.714050 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_133259 XM_006711915 XM_006711916 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33189 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06343 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||