Homo sapiens Gene: OPTN | |||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-54466.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | OPTN | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | optineurin | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ALS12; FIP2; GLC1E; HIP7; HYPL; NRP; TFIIIA-INTP | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000123240 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
optineurin
optineurin
optineurin
optineurin
optineurin
optineurin
optineurin
optineurin
optineurin
optineurin
|
||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
OPTN (optineurin) has a role in the inhibition of virus-triggered IFNB1 induction.
|
||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes the coiled-coil containing protein optineurin. Optineurin may play a role in normal-tension glaucoma and adult-onset primary open angle glaucoma. Optineurin interacts with adenovirus E3-14.7K protein and may utilize tumor necrosis factor-alpha or Fas-ligand pathways to mediate apoptosis, inflammation or vasoconstriction. Optineurin may also function in cellular morphogenesis and membrane trafficking, vesicle trafficking, and transcription activation through its interactions with the RAB8, huntingtin, and transcription factor IIIA proteins. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:13099449-13138308 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | p13 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 103 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
|
||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition pathway
Cell Cycle pathway
G2/M Transition pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Mitotic G2-G2/M phases pathway
|
||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.332706 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001008211 NM_001008212 NM_001008213 NM_021980 XM_005252336 XM_005252337 XM_005252338 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7094 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03891 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||