Homo sapiens Gene: PRPF18 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-55250.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRPF18 | ||||||||||||||||||
Gene Name | PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | hPrp18; PRP18 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000165630 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae)
PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae)
PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae)
|
||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
Pre-mRNA splicing occurs in 2 sequential transesterification steps. The protein encoded by this gene is found to be essential for the catalytic step II in pre-mRNA splicing process. It is found in the spliceosome, and contains seven WD repeats, which function in protein-protein interactions. This protein has a sequence similarity to the yeast splicing factor Prp18. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:13586927-13630868 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | p13 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5T9P7 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8559 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.729158 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003675 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17351 | ||||||||||||||||||
OMIM | 604993 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7100 | ||||||||||||||||||
HPRD | 05407 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AL157392 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 8559 | ||||||||||||||||||