Homo sapiens Gene: XRCC1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-55268.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | XRCC1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | RCC | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000073050 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is involved in the efficient repair of DNA single-strand breaks formed by exposure to ionizing radiation and alkylating agents. This protein interacts with DNA ligase III, polymerase beta and poly (ADP-ribose) polymerase to participate in the base excision repair pathway. It may play a role in DNA processing during meiogenesis and recombination in germ cells. A rare microsatellite polymorphism in this gene is associated with cancer in patients of varying radiosensitivity. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:43543040-43580473 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.31 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 64 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Resolution of AP sites via the single-nucleotide replacement pathway pathway
Resolution of Abasic Sites (AP sites) pathway
Base Excision Repair pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Base excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
E2F transcription factor network
FOXM1 transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | M0QYS5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7515 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.98493 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_006297 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12828 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 194360 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12624 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01909 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC006276 AC018758 L34079 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 7515 | ||||||||||||||||||||||