Homo sapiens Gene: SNRPB2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-55609.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNRPB2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B | ||||||||||||||||||
Synonyms | Msl1 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000125870 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B
small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene associates with stem loop IV of U2 small nuclear ribonucleoprotein (U2 snRNP) in the presence of snRNP-A'. The encoded protein may play a role in pre-mRNA splicing. Autoantibodies from patients with systemic lupus erythematosus frequently recognize epitopes on the encoded protein. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene associates with stem loop IV of U2 small nuclear ribonucleoprotein (U2 snRNP) in the presence of snRNP-A\'. The encoded protein may play a role in pre-mRNA splicing. Autoantibodies from patients with systemic lupus erythematosus frequently recognize epitopes on the encoded protein. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:16729961-16742563 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | p12.1 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 49 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003092 NM_198220 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13123 | ||||||||||||||||||
HPRD | 04628 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||