Homo sapiens Gene: ADARB1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-5701.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ADARB1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | adenosine deaminase, RNA-specific, B1 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ADAR2; DRABA2; DRADA2; RED1 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000197381 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
adenosine deaminase, RNA-specific, B1
adenosine deaminase, RNA-specific, B1
adenosine deaminase, RNA-specific, B1
adenosine deaminase, RNA-specific, B1
adenosine deaminase, RNA-specific, B1
adenosine deaminase, RNA-specific, B1
adenosine deaminase, RNA-specific, B1
adenosine deaminase, RNA-specific, B1
adenosine deaminase, RNA-specific, B1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes the enzyme responsible for pre-mRNA editing of the glutamate receptor subunit B by site-specific deamination of adenosines. Studies in rat found that this enzyme acted on its own pre-mRNA molecules to convert an AA dinucleotide to an AI dinucleotide which resulted in a new splice site. Alternative splicing of this gene results in several transcript variants, some of which have been characterized by the presence or absence of an ALU cassette insert and a short or long C-terminal region. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 21:45073853-45226560 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 22 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
C6 deamination of adenosine pathway
Formation of editosomes by ADAR proteins pathway
mRNA Editing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Editing: A to I Conversion pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8TCX7 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 104 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001112 NM_001160230 NM_015833 NM_015834 XM_006723953 XM_006723954 XM_006723955 XM_006723956 XM_006723957 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:226 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601218 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33589 CCDS33590 CCDS42970 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AY082339 CH471079 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAL99252 EAX09362 | ||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 104 | ||||||||||||||||||||||||||