Homo sapiens Gene: OAS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-58231.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | OAS1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | 2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IFI-4; OIAS; OIASI | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000089127 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
OAS1 is a pathogen recognition receptor for the viral pathogen-associated molecular pattern, double-stranded RNA. Upon recognition of dsRNA, the OAS1 activates RNASEL to cleave ssRNA. The OAS/RNASEL pathway triggers the RIG-I pathway and induce IFNB production.
OAS1 is a cytoplasmic dsRNA sensor.
Antiviral activity of the 2â?²,5â?²-oligoadenylate synthetase (OAS) gene variants against dengue virus shows strong and serotype-specific disparities.
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the 2-5A synthetase family, essential proteins involved in the innate immune response to viral infection. The encoded protein is induced by interferons and uses adenosine triphosphate in 2'-specific nucleotidyl transfer reactions to synthesize 2',5'-oligoadenylates (2-5As). These molecules activate latent RNase L, which results in viral RNA degradation and the inhibition of viral replication. The three known members of this gene family are located in a cluster on chromosome 12. Mutations in this gene have been associated with host susceptibility to viral infection. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a member of the 2-5A synthetase family, essential proteins involved in the innate immune response to viral infection. The encoded protein is induced by interferons and uses adenosine triphosphate in 2\'-specific nucleotidyl transfer reactions to synthesize 2\',5\'-oligoadenylates (2-5As). These molecules activate latent RNase L, which results in viral RNA degradation and the inhibition of viral replication. The three known members of this gene family are located in a cluster on chromosome 12. Mutations in this gene have been associated with host susceptibility to viral infection. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:112906777-112932185 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q24.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
Interferon gamma signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Hepatitis C pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8VUC8 Q1P9K4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4938 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.524760 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001032409 NM_002534 NM_016816 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8086 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 164350 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31905 CCDS41838 CCDS44980 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 08879 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC004551 DQ473588 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | ABE27978 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 4938 | ||||||||||||||||||||||||||||||