Homo sapiens Gene: DDX54 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-58514.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX54 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000123064 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the DEAD box protein family. DEAD box proteins, characterized by the conserved motif Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), are putative RNA helicases. They are implicated in a number of cellular processes involving alteration of RNA secondary structure such as translation initiation, nuclear and mitochondrial splicing, and ribosome and spliceosome assembly. Based on their distribution patterns, some members of this family are believed to be involved in embryogenesis, spermatogenesis, and cellular growth and division. The nucleolar protein encoded by this gene interacts in a hormone-dependent manner with nuclear receptors, and represses their transcriptional activity. Alternative splice variants that encode different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:113157174-113185479 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q24.13 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 19 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated nuclear estrogen receptor beta network
Validated nuclear estrogen receptor alpha network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.506861 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001111322 NM_024072 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31907 CCDS44984 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 13129 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||