Homo sapiens Gene: CLCF1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-60145.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLCF1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cardiotrophin-like cytokine factor 1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BSF-3; BSF3; CISS2; CLC; NNT-1; NNT1; NR6 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000175505 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cardiotrophin-like cytokine factor 1
cardiotrophin-like cytokine factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the glycoprotein (gp)130 cytokine family and encodes cardiotrophin-like cytokine factor 1 (CLCF1). CLCF1 forms a heterodimer complex with cytokine receptor-like factor 1 (CRLF1). This dimer competes with ciliary neurotrophic factor (CNTF) for binding to the ciliary neurotrophic factor receptor (CNTFR) complex, and activates the Jak-STAT signaling cascade. CLCF1 can be actively secreted from cells by forming a complex with soluble type I CRLF1 or soluble CNTFR. CLCF1 is a potent neurotrophic factor, B-cell stimulatory agent and neuroendocrine modulator of pituitary corticotroph function. Defects in CLCF1 cause cold-induced sweating syndrome 2 (CISS2). This syndrome is characterized by a profuse sweating after exposure to cold as well as congenital physical abnormalities of the head and spine. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:67364168-67374177 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q13.2 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UBD9 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23529 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.502977 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001166212 NM_013246 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17412 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 607672 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31617 CCDS53666 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF172854 AF176911 AF176912 AK298052 AP003419 AY049779 BC012939 BC066229 BC066230 BC066231 CH471076 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD54284 AAF00991 AAF00992 AAH12939 AAH66229 AAH66230 AAH66231 AAL15436 BAG60346 EAW74601 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 23529 | ||||||||||||||||||||||||