Bos taurus Gene: CLCF1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-644688.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLCF1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000046110 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cardiotrophin-like cytokine factor 1
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000175505:
This gene is a member of the glycoprotein (gp)130 cytokine family and encodes cardiotrophin-like cytokine factor 1 (CLCF1). CLCF1 forms a heterodimer complex with cytokine receptor-like factor 1 (CRLF1). This dimer competes with ciliary neurotrophic factor (CNTF) for binding to the ciliary neurotrophic factor receptor (CNTFR) complex, and activates the Jak-STAT signaling cascade. CLCF1 can be actively secreted from cells by forming a complex with soluble type I CRLF1 or soluble CNTFR. CLCF1 is a potent neurotrophic factor, B-cell stimulatory agent and neuroendocrine modulator of pituitary corticotroph function. Defects in CLCF1 cause cold-induced sweating syndrome 2 (CISS2). This syndrome is characterized by a profuse sweating after exposure to cold as well as congenital physical abnormalities of the head and spine. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, Oct 2009] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 29:45910397-45912701 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||
Transcript Frequencies | |||||||||||||||||||||||
Tag Count based mRNA-Abundances across 87 different Tissues (TPM).
Based on Data from Bovine Gene Atlas |
(Move your mouse over the image to view a more detailed version) |
||||||||||||||||||||||