Mus musculus Gene: Clcf1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-129271.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Clcf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cardiotrophin-like cytokine factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Bsf3; CLC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000040663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cardiotrophin-like cytokine factor 1
cardiotrophin-like cytokine factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000175505:
This gene is a member of the glycoprotein (gp)130 cytokine family and encodes cardiotrophin-like cytokine factor 1 (CLCF1). CLCF1 forms a heterodimer complex with cytokine receptor-like factor 1 (CRLF1). This dimer competes with ciliary neurotrophic factor (CNTF) for binding to the ciliary neurotrophic factor receptor (CNTFR) complex, and activates the Jak-STAT signaling cascade. CLCF1 can be actively secreted from cells by forming a complex with soluble type I CRLF1 or soluble CNTFR. CLCF1 is a potent neurotrophic factor, B-cell stimulatory agent and neuroendocrine modulator of pituitary corticotroph function. Defects in CLCF1 cause cold-induced sweating syndrome 2 (CISS2). This syndrome is characterized by a profuse sweating after exposure to cold as well as congenital physical abnormalities of the head and spine. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:4214238-4223490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.347919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_019952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||