Bos taurus Gene: ARID5B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-629008.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ARID5B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | AT-rich interactive domain-containing protein 5B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000006729 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
AT rich interactive domain 5B (MRF1-like)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000150347:
This gene encodes a member of the AT-rich interaction domain (ARID) family of DNA binding proteins. The encoded protein forms a histone H3K9Me2 demethylase complex with PHD finger protein 2 and regulates the transcription of target genes involved in adipogenesis and liver development. This gene also plays a role in cell growth and differentiation of B-lymphocyte progenitors, and single nucleotide polymorphisms in this gene are associated with acute lymphoblastic leukemia. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 28:18003736-18191994 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Chromatin organization pathway
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G5E585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 783538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002698842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02061648 DAAA02061649 DAAA02061650 DAAA02061651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 783538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||