Bos taurus Gene: TRPM1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-630449.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRPM1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000001639 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000134160:
This gene encodes a member of the transient receptor potential melastatin subfamily of transient receptor potential ion channels. The encoded protein is a calcium permeable cation channel that is expressed in melanocytes and may play a role in melanin synthesis. Specific mutations in this gene are the cause autosomal recessive complete congenital stationary night blindness-1C. The expression of this protein is inversely correlated with melanoma aggressiveness and as such it is used as a prognostic marker for melanoma metastasis. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 21:27993518-28055083 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Ion channel transport pathway
TRP channels pathway
Stimuli-sensing channels pathway
Ion channel transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
TRP channels pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MPU3 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 527638 | ||||||||||||||||||
UniGene | Bt.88420 | ||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002696605 XM_606035 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7146 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02052355 DAAA02052356 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 527638 | ||||||||||||||||||