Mus musculus Gene: Trpm1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-190849.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trpm1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4732499L03Rik; AI606771; Ltrpc1; melastatin; Mlsn1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030523 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000134160:
This gene encodes a member of the transient receptor potential melastatin subfamily of transient receptor potential ion channels. The encoded protein is a calcium permeable cation channel that is expressed in melanocytes and may play a role in melanin synthesis. Specific mutations in this gene are the cause autosomal recessive complete congenital stationary night blindness-1C. The expression of this protein is inversely correlated with melanoma aggressiveness and as such it is used as a prognostic marker for melanoma metastasis. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:64153835-64269775 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Ion channel transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
TRP channels pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Ion channel transport pathway
TRP channels pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.38875 Mm.404453 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001039104 NM_018752 XM_006540690 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS21332 CCDS39975 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||