Bos taurus Gene: NPAS2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-630469.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NPAS2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | neuronal PAS domain-containing protein 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000019697 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
neuronal PAS domain-containing protein 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the basic helix-loop-helix (bHLH)-PAS family of transcription factors. A similar mouse protein may play a regulatory role in the acquisition of specific types of memory. It also may function as a part of a molecular clock operative in the mammalian forebrain. [provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:5907340-6000528 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 19 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Circadian rhythm pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A4IFH3 F6QL92 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 614049 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.55456 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001083763 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | BC134580 DAAA02030201 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI34581 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 614049 | ||||||||||||||||||||||