Bos taurus Gene: LOC407111 | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632305.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LOC407111 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000032808 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Fas ligand
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000117560:
The protein encoded by this gene is the ligand for FAS. Both are transmembrane proteins. Interaction of FAS with this ligand is critical in triggering apoptosis of some types of cells such as lymphocytes. Defects in this gene may be related to some cases of systemic lupus erythematosus (SLE). [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:41027788-41036681 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 69 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
FasL/ CD95L signaling pathway
Extrinsic Pathway for Apoptosis pathway
Apoptosis pathway
Death Receptor Signalling pathway
Apoptosis pathway
Dimerization of procaspase-8 pathway
Caspase-8 activation by cleavage pathway
FasL/ CD95L signaling pathway
Death Receptor Signalling pathway
Regulation by c-FLIP pathway
Extrinsic Pathway for Apoptosis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Apoptosis pathway
MAPK signaling pathway pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Type I diabetes mellitus pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
Allograft rejection pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
Graft-versus-host disease pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Pathways in cancer pathway
Chagas disease (American trypanosomiasis) pathway
African trypanosomiasis pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Type I diabetes mellitus pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
MAPK signaling pathway pathway
Apoptosis pathway
Allograft rejection pathway
Graft-versus-host disease pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Pathways in cancer pathway
Chagas disease (American trypanosomiasis) pathway
African trypanosomiasis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
JAK STAT pathway and regulation pathway
GPCR signaling pathway
Fas signaling pathway pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
GPCR signaling pathway
Fas signaling pathway pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Calcium signaling in the CD4+ TCR pathway
Caspase Cascade in Apoptosis
Downstream signaling in naïve CD8+ T cells
IL12-mediated signaling events
Calcineurin-regulated NFAT-dependent transcription in lymphocytes
FoxO family signaling
IL2 signaling events mediated by STAT5
HIV-1 Nef: Negative effector of Fas and TNF-alpha
FAS (CD95) signaling pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.102896 Bt.28024 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001098859 XM_005194803 XM_005216882 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||