Bos taurus Gene: MYOD1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632365.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MYOD1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | myoblast determination protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MyoD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000002216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
myoblast determination protein 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000129152:
This gene encodes a nuclear protein that belongs to the basic helix-loop-helix family of transcription factors and the myogenic factors subfamily. It regulates muscle cell differentiation by inducing cell cycle arrest, a prerequisite for myogenic initiation. The protein is also involved in muscle regeneration. It activates its own transcription which may stabilize commitment to myogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:35331401-35334046 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 87 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
ID pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
CDO in myogenesis pathway
Developmental Biology pathway
Myogenesis pathway
Myogenesis pathway
CDO in myogenesis pathway
Developmental Biology pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of retinoblastoma protein
Notch-mediated HES/HEY network
C-MYB transcription factor network
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
Signaling events mediated by HDAC Class III
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | O77799 Q0VBX9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 281938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.13078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001040478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF093675 BC120454 DAAA02040581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC63373 AAI20455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 281938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||