Bos taurus Gene: PTPRK | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632960.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PTPRK | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000020829 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protein tyrosine phosphatase, receptor type, K
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000152894:
The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP possesses an extracellular region, a single transmembrane region, and two tandem catalytic domains, and thus represents a receptor-type PTP. The extracellular region contains a meprin-A5 antigen-PTP mu (MAM) domain, an Ig-like domain and four fibronectin type III-like repeats. This PTP was shown to mediate homophilic intercellular interaction, possibly through the interaction with beta- and gamma-catenin at adherens junctions. Expression of this gene was found to be stimulated by TGF-beta 1, which may be important for the inhibition of keratinocyte proliferation. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:66968686-67594209 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Calcineurin-regulated NFAT-dependent transcription in lymphocytes
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MME1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 509657 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.7319 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001191537 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02026580 DAAA02026581 DAAA02026582 DAAA02026583 DAAA02026584 DAAA02026585 DAAA02026586 DAAA02026587 DAAA02026588 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 509657 | ||||||||||||||||||||||||||||||