Bos taurus Gene: BT.49360 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632995.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.49360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear receptor ROR-gamma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear receptor ROR-gamma
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Differentiation of Type 3 innate lymphoid cells (ILC3) to IL7R(+) ILC1 is reversible whereas IL7R(+) ILC1 can differentiate to ILC3 in the presence of IL2, IL23A, and IL1B dependent on the transcription factor RORC, and this process is enhanced in the presence of retinoic acid.
[Mus musculus] Gata3 plays a generalized role in innate lymphoid cell (ILC) lineage determination and is critical for the development of gut Rorc+ group 3 ILCs subsets that maintain mucosal barrier homeostasis.
[Mus musculus] Retinoic acid (RA) induces the maturation of lymphoid tissue inducer cells in developing lymph nodes by inducing RA receptor binding to the promoter region of Rorc.
[Mus musculus] Rorc is differentially required in the maintenance of TH17 cell and group 3 innate lymphoid cell responses.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000143365:
The protein encoded by this gene is a DNA-binding transcription factor and is a member of the NR1 subfamily of nuclear hormone receptors. The specific functions of this protein are not known; however, studies of a similar gene in mice have shown that this gene may be essential for lymphoid organogenesis and may play an important regulatory role in thymopoiesis. In addition, studies in mice suggest that the protein encoded by this gene may inhibit the expression of Fas ligand and IL2. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:18991963-19015891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 37 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Gene Expression pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Gene Expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001083451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||