Bos taurus Gene: EPAS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-633312.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | EPAS1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | endothelial PAS domain-containing protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000003711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
endothelial PAS domain-containing protein 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000116016:
This gene encodes a transcription factor involved in the induction of genes regulated by oxygen, which is induced as oxygen levels fall. The encoded protein contains a basic-helix-loop-helix domain protein dimerization domain as well as a domain found in proteins in signal transduction pathways which respond to oxygen levels. Mutations in this gene are associated with erythrocytosis familial type 4. [provided by RefSeq, Nov 2009] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:28576347-28668899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 99 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha pathway
Regulation of gene expression by Hypoxia-inducible Factor pathway
Oxygen-dependent asparagine hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha pathway
Cellular responses to stress pathway
Developmental Biology pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
Regulation of Hypoxia-inducible Factor (HIF) by oxygen pathway
Cellular response to hypoxia pathway
Cellular responses to stress pathway
Cellular response to hypoxia pathway
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha pathway
Regulation of Hypoxia-inducible Factor (HIF) by oxygen pathway
Oxygen-dependent asparagine hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha pathway
Regulation of gene expression by Hypoxia-inducible Factor pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
Developmental Biology pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Renal cell carcinoma pathway
Pathways in cancer pathway
Renal cell carcinoma pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
HIF-2-alpha transcription factor network
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.101403 Bt.45570 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||